解决方案:开发vcflibpy库,提供快速读取、过滤、分析VCF文件的功能。 技术实现: 读取:支持多种VCF版本,能够快速加载文件。 过滤:提供灵活的过滤机制,如基于质量分数、变异类型等。 分析:集成常用统计分析工具,如变异频率计算、基因型分布分析等。
使用装饰器和logging模块可以快速调试,优化PythonI/O性能达到快速查找
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